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企业合并过程中可能遇到的挑战主要包括法律合规性问题、反垄断审查风险、资产和债务处理难题、员工安置与劳动合同变更问题以及企业文化融合等。这些挑战不仅关系到合并能否顺利完成，还直接影响到合并后企业的运营与发展。
股东权益的保护是公司治理中的重要一环，通过在公司章程中明确规定相关条款可以有效保障股东尤其是小股东的利益不受侵害。本回答将从法律角度出发，探讨如何通过公司章程来加强股东权益的保护，并提供相应的法律回答。
在公司注册过程中，需重点关注公司名称的选择、注册资本的确定、股东与出资比例、经营范围以及住所地等事项。这些方面不仅关系到公司的合法设立，还直接影响到公司后续运营的合规性。此外，还需注意相关法律文件的准备及提交流程。